Η Ελληνική Σπηλαιολογική Εταιρεία έχει καταγράψει πάνω από 3.000 σπήλαια στην Κρήτη. Δεν είναι μόνο εκπληκτικά παραδείγματα του ταλέντου της φύσης στην εσωτερική διακόσμηση, αλλά και πολλά από αυτά έχουν επίσης μεγάλη επιστημονική αξία.
Οι Μινωίτες άρχισαν το έθιμο να λατρεύουν τους θεούς τους σε μικρά παλάτια ή ιερά, σε ιερές σπηλιές και σε ιερά χτισμένα σε βουνοκορφές και κορυφές λόφων.
Το Σπήλαιο της ΣΦΕΔΩΝΗΣ Ζωνιανών: Είναι το πλουσιότερο στην Κρήτη από άποψη φυσικής διακόσμησης
Το Δικταίο Σπήλαιο: Η θρυλική γενέτειρα του Δία, μπορείτε να φτάσετε στα περίχωρα του χωριού Ψυχρό (48 χλμ. από το Ηράκλειο)
Το σπήλαιο του Ιδαίου: Σύμφωνα με τη μυθολογία, η Ρέα έκρυψε το μωρό Δία από τον δολοφόνο Κρόνο. Εδώ έχουν βρεθεί λατρευτικά αντικείμενα, μαζί με αγάλματα και χάλκινες ασπίδες
Το Σπήλαιο της Ειλείθυιας (Ηλιθυία): Ήταν σπήλαιο τελετουργικών λατρειών από τη νεολιθική εποχή έως τον 5ο αιώνα π.Χ.
Το Σπήλαιο του Αγ. Παρασκευή Σκοτίνου: Πολύ ενδιαφέρον σπήλαιο όπου τελούνταν λατρεία τόσο στην αρχαιότητα όσο και κατά τη χριστιανική εποχή
Σπήλαιο Καμάρες: Ιδρύθηκε κατά τη Μινωική περίοδο ως ιερός τόπος, πιθανόν αφιερωμένος στη λατρεία της θεάς Ειλείθυιας
Σπήλαιο Γεράνι Ρεθύμνου: Ένα σπήλαιο με προϊστορικό, παλαιοντολογικό και αρχαιολογικό ενδιαφέρον
Σπήλαιο Μελιδονίου: Αποτελούσε λατρευτικό σπήλαιο κατά τη νεολιθική, τη μινωική και την αρχαϊκή περίοδο
